############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data smokingMouse ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘smokingMouse/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘smokingMouse’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘smokingMouse.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 156-219 (smokingMouse.Rmd) Error: processing vignette 'smokingMouse.Rmd' failed with diagnostics: subscript out of bounds --- failed re-building ‘smokingMouse.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘smokingMouse.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted