############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data PANTHER.db ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘PANTHER.db/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘PANTHER.db’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... OK Warning: ‘inst/doc’ files ‘PANTHER.db.Rmd’, ‘PANTHER.db.html’ ignored as vignettes have been rebuilt. Run R CMD build with --no-build-vignettes to prevent rebuilding. * excluding invalid files Subdirectory 'man' contains invalid file names: ‘PANTHERDB-class.R’ * checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts * checking for empty or unneeded directories * building ‘PANTHER.db_1.0.12.tar.gz’