############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data coMET ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘coMET/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘coMET’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘coMET.Rnw’ using knitr Quitting from lines 337-345 [cometwebPlot] (coMET.Rnw) Error: processing vignette 'coMET.Rnw' failed with diagnostics: Timeout was reached [genome.ucsc.edu]: SSL connection timeout --- failed re-building ‘coMET.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘coMET.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted